论文研究 - RNA-Seq和散装分离基因分析与高生长的相关基因

银杏的寿命很长，其生长相对较慢。 但是，对该物种中与生长相关的基因知之甚少。 我们通过在转录组水平上开发多态性分子标记，将mRNA测序（RNA-Seq）与大量分离子分析（BSA）结合起来，精细绘制重要的农艺性状基因。 在这项研究中，对银杏半同胞家族的高生长（GD）和低生长（BD）样品进行了转录组测序。 组装干净的读段后，检测到601个差异表达基因，其中513个被分配了功能注释。 单核苷酸多态性（SNP）分析鉴定出与GD和BD组中的119个基因相关的SNP； 这些基因中有58个带有注释。 与BD组相比，GD组中两个Homeobox-亮氨酸拉链蛋白基因上调。 因此，这些很可能与银杏的高生长有关。