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等度量映射(Isomap)是最经典的非线性映射降维方法之一,它在MDS的基础上引入了“测地距离”的概念,直接解决了MDS使用欧氏距离无法应对非线性流形的问题。
代码片段和文件信息
# -*- coding: utf-8 -*-
“““
Isomap
“““
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn import datasetsmanifold
def load_data():
‘‘‘
加载用于降维的数据
:return: 一个元组,依次为训练样本集和样本集的标记
‘‘‘
iris=datasets.load_iris()# 使用 scikit-learn 自带的 iris 数据集
return iris.datairis.target
def test_Isomap(*data):
‘‘‘
测试 Isomap 的用法
:param data: 可变参数。它是一个元组,这里要求其元素依次为:训练样本集、训练样本的标记
:return: None
‘‘‘
Xy=data
for n in [4321]: # 依次考察降维目标为 4维、3维、2维、1维
isomap=manifold.Isomap(n_components=n)
isomap.fit(X)
print(‘reconstruction_error(n_components=%d) : %s‘%
(n isomap.reconstruction_error()))
def plot_Isomap_k(*data):
‘‘‘
测试 Isomap 中 n_neighbors 参数的影响,其中降维至 2维
:param data: 可变参数。它是一个元组,这里要求其元素依次为:
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