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利用python绘制热图、计算网络节点degree、kshell、介数中心性、接近中心性、特征向量中心性、PageRank,计算相关性含环境、代码、数据源

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代码片段和文件信息

‘‘‘
Created on 20170511
@author: Cherry
‘‘‘
import csv
from matplotlib import cm
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.ticker import MultipleLocator
from matplotlib.ticker import FormatStrFormatter
from matplotlib.pyplot import savefig



degrees = []
kshells = []
upper_values = []
eu_values = []
el_values = []
lower_values = []





root = ‘D:/Cherry/data/netsci‘
dataPath = root + ‘/result_f_distribution.csv‘

def readData():
    with open(dataPath ‘r‘) as f:
        i = 0
        for row in csv.reader(f.read().splitlines()):
            if i == 0:
                i += 1
            else:
                id kshell degree upper eu el lower = [i for i in row]
                degrees.append(degree)
                kshells.append(kshell)
                upper_values.append(upper)
                eu_values.append(eu)
                el_values.append(el)
                lower_values.append(lower)
            
def getSize():
    max_degree = 0
    max_kshell = 0
    for degree in degrees:
        if max_degree < int(degree):
            max_degree = int(degree)
            
    for kshell in kshells:
        if max_kshell < kshell:
            max_kshell = kshell
    return max_degree max_kshell

def generateZ(max_degree max_kshell):
    max_degree = int(max_degree)
    max_kshell = int(max_kshell)
    z_upper_values = [None] * max_kshell
    z_eu_values = [None] * max_kshell
    z_el_values = [None] * max_kshell
    z_lower_values = [None] * max_kshell
    for i in range(len(z_upper_values)):
        z_upper_values[i] = [0] * max_degree
        z_eu_values[i] = [0] * max_degree
        z_el_values[i] = [0] * max_degree
        z_lower_values[i] = [0] * max_degree
        
        
    for j in range(len(degrees)):
        index_x = degrees[j]  # get the degree named index_x then regard the index_x-1 as the zvalue[][]‘s second dimention index.   zvalue[][index-x-1]
        index_y = kshells[j]  # get the kshell named index_y then regard the max-kshell-index_y as the zvalue[][]‘s first dimention index.  zvalue[max_kshell][]
        upperValue = upper_values[j]
        z_upper_values[int(max_kshell) - int(index_y)][int(index_x) - 1] = float(upperValue)
        euValue = eu_values[j]
        z_eu_values[int(max_kshell) - int(index_y)][int(index_x) - 1] = float(euValue)
        elValue = el_values[j]
        z_el_values[int(max_kshell) - int(index_y)][int(index_x) - 1] = float(elValue)
        lowerValue = lower_values[j]
        z_lower_values[int(max_kshell) - int(index_y)][int(index_x) - 1] = float(lowerValue)
        
    return z_upper_values z_eu_values z_el_values z_lower_values
        
def draw_heatmap(data0 xlabels ylabels savepath titleStr):
    cmap = cm.Blues
    figure = plt.figure(facecolor=‘w‘)
    
    # set the font
    font = {‘family‘ : ‘serif‘ ‘color‘  : ‘darkred‘ ‘weight‘ : ‘normal‘ ‘size‘   : 16 }
    titlefont = {‘

 属性            大小     日期    时间   名称
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     文件       5107  2017-05-12 12:27  python环境、代码及数据\代码\DrawHeatMap.py

     文件       7416  2017-05-10 18:38  python环境、代码及数据\其他不相关\output1.csv

     文件    1381985  2017-05-10 18:41  python环境、代码及数据\其他不相关\result_merged.csv

     文件       8221  2017-05-04 19:46  python环境、代码及数据\其他不相关\代码\CalCorrelation1_9_S.py

     文件       2639  2017-05-11 17:33  python环境、代码及数据\其他不相关\代码\Cal_DKBCEP.py

     文件    1781978  2017-04-27 16:47  python环境、代码及数据\其他不相关\代码\python_igraph-0.7.1.post6-cp27-none-win_amd64.whl

     文件        407  2017-05-12 14:48  python环境、代码及数据\其他不相关\说明.txt

     文件       2973  2017-05-10 18:41  python环境、代码及数据\数据文件\result_f_distribution.csv

     文件          0  2017-05-12 14:41  python环境、代码及数据\新建文本文档.txt

     文件    6140635  2017-01-15 10:17  python环境、代码及数据\环境\matplotlib-1.5.3-cp27-cp27m-win_amd64.whl

     文件   32997908  2017-01-15 09:35  python环境、代码及数据\环境\numpy-1.11.3+mkl-cp27-cp27m-win_amd64.whl

     文件   19382272  2017-01-14 21:53  python环境、代码及数据\环境\python-2.7.10.amd64.msi

     目录          0  2017-05-12 14:32  python环境、代码及数据\其他不相关\代码

     目录          0  2017-05-12 14:32  python环境、代码及数据\其他不相关\包

     目录          0  2017-05-12 14:29  python环境、代码及数据\代码

     目录          0  2017-05-12 14:32  python环境、代码及数据\其他不相关

     目录          0  2017-05-12 14:29  python环境、代码及数据\数据文件

     目录          0  2017-05-12 14:49  python环境、代码及数据\环境

     目录          0  2017-05-12 14:41  python环境、代码及数据

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